陈兴

中国矿业大学人工智能研究院副院长
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陈兴,中国矿业大学教授、博士生导师(均31岁直接破格,2016年),2019年科睿唯安全球高被引科学家,2017年全球排名前十万科学家(排名全球第12060位)中国矿业大学生物信息研究所所长,中国矿业大学人工智能研究院大数据研究中心主任,中国矿业大学首批越崎学者,江苏省六大人才高峰高层次人才,中国工业与应用数学学会数学生命科学专业委员会秘书长,中国计算机学会生物信息学专业委员会委员,江苏省双创团队核心成员。六家SCI杂志副主编、八家SCI杂志编委、七家SCI杂志首席特约编委和十四家国际会议程序委员会成员。以一作或通讯发表SCI论文100余篇,影响因子累计约510,因子大于9论文8篇,以一作或通讯在四大生物信息顶级期刊发表论文21篇。论文被引共计6031次,17篇论文入选最新一期ESI高被引论文,H-因子为41,单篇最高引为659。获教育部高等学校科学研究优秀成果奖自然科学奖二等奖(排名第3)、江苏省科学技术奖三等奖(排名第1)、江苏省教育教学与研究成果奖高校自然科学研究类一等奖(排名第1)、淮海科技英才奖、多个国际会议的最佳论文奖、世界华人数学家大会新世界数学奖等荣誉,主持国家自然科学基金面上项目(2项)、青年基金、江苏省和中国矿业大学的高层次人才项目等,以主要成员身份参与国家自然科学基金重点项目(2项,1项为子课题负责人)、重大研究计划培育项目、数学天元基金、江苏省“双创计划”团队项目等项目。 [1-6]
中文名
陈兴
外文名
Xing Chen
国    籍
中国
民    族
汉族
出生地
安徽省巢湖市
出生日期
1984年
毕业院校
中国科学院
主要成就
2019年科睿唯安全球高被引科学家 [1]
主要成就
中国矿业大学人工智能研究院副院长、教授、博导、中国矿业大学生物信息研究所所长 [1] [5]
2017年全球排名前十万科学家(排名全球第12060位) [1]
教育部高等学校优秀成果奖二等奖、中国矿业大学首批越崎学者等 [1]
六家SCI杂志副主编 [1]
八家SCI杂志编委 [1]展开
职    称
教授

工作经历

播报
编辑
2020.8-2021年 中奔慨匪国矿业大学教授 渗设永灶博导 [1-6]
2016.5拘赠晚- 中国矿业大学信息与控制工程学院,教授、博导、中国矿业大学首批越崎学者、中国矿业大学生物信息研究所所长 [1-4] [6]
2012.7-2016.精格5 中国科学院国家数学与交叉科学中心生物医学部 助理研究员 [1-4]
陈兴
2012.7- 2016项翻危.5 龙店请中欢旬纹国科学院漏束数学与系统科学研究院 助理研究员 [1-4]

主要成就

播报
编辑
陈兴,中国矿业大学教授、博士生导师(均31岁时直接破格,2016年),2019年科睿唯安全球高被引科学家,2017年全球排名前十万科学家(排名全球第12060位),中国矿业大学人工智能研究院副院长,中国矿业大学生物信息研究所所长,中国矿业大学人工智能研究院大数据研究中心主任,中国矿业大学首批越崎学者,江苏省六大人才高峰高层次人才,中国工业与应用数学学会数学生命科学专业委员会秘书长,中国计算机学会生物信息学专业委员会委员,江苏省双创团队核心成员。Journal of Cellular and Molecular Medicine、BMC Bioinformatics、BMC Systems Biology等六家SCI杂志副主编,International Journal of Molecular Sciences、International Journal of Biological Sciences、Briefings in Functional Genomics等八家SCI杂志编委,Frontiers in Microbiology、Current Medicinal Chemistry等七家SCI杂志首席特约编委,十四家国际生物信息学会议程序委员会成员。以一作或通讯发表SCI论文100余篇,影响因子累计约510,因子大于9论文8篇,以一作或通讯在Bioinformatics、PLoS Computational Biology、Briefings in Bioinformatics、Nucleic Acids Research上发表论文19篇。论文被引共计6031次,17篇论文入选最新一期ESI高被引论文,H-因子为37,单篇最高引为600。获教育部高等学校科学研究优秀成果奖自然科学奖二等奖、江苏省科学技术奖三等奖、江苏省教育教学与研究成果奖高校自然科学研究类一等奖、淮海科技英才奖、多个国际会议的最佳论文奖、世界华人数学家大会新世界数学奖等荣誉,主持国家自然科学基金面上项目(2项)、青年基金、江苏省和中国矿业大学的高层次人才项目、中国矿业大学重大项目培育专项等项目,参与国家自然科学基金重点项目(2项,1项为子课题负责人)、重大研究计划培育项目、数学天元基金、江苏省“双创计划”团队项目等项目。 [1-6]

项目经历

国家自然科学基金面上项目,61972399,基于多源数据融合的药物响应和药物相关非编码RNA靶点预测研究,2020/01-2023/12,60万,在研,项目主持 [2]
国家自然科学基金重点项目,11931008,基于图与组合优化的生物数据和网络数据挖掘算法研究,2020/01-2024/12,270万,在研,项目骨干 [2]
中国矿业大学重大项目培育专项,基于生物医学信息的非编码RNA药物靶点数据分析与智能预测方法研究,2019/08-2022/07,30万,在研,项目主持 [2]
深圳大学深圳移动互联网应用中间件技术工程实验室开放课题,基于智能算法的长非编码RNA与疾病关联类型预测研究,2019/06-2020/06,5万,在研,项目主持 [2]
广东省移动互联网应用中间件工程技术研究中心开发课题,基于机器学习和复杂网络方法的药物靶点相互作用预测研究,2018/12-2019/11,5万,在研,项目主持 [2]
江苏省“双创计划”团队项目,新型非晶合金的制备原理及其在能源环境领域的开发应用,2018/10-2021/10,500万,在研,项目核心成员 [2]
深圳大学大数据系统计算技术国家工程实验室开放课题,SZU-BDSC-XY-2018-01,基于智能算法的lncRNA功能预测研究,2018/04-2020/03,5万,在研,项目主持 [2]
国家自然科学基金面上项目,61772531,多视角识别长非编码RNA和人类复杂疾病关联预测研究,2018/01-2018/12,19.2万,在研,项目主持 [2]
广东省移动互联网应用中间件工程技术研究中心开发课题,疾病相关miRNA预测研究,2017/12-2018/11,5万,在研,项目主持 [2]
江苏省第十四批“六大人才高峰”高层次人才项目,SWYY-089,长非编码RNA生物大数据处理和预测,2017/07-2020/06,4万,在研,项目主持 [2]
中国矿业大学学科前沿科学研究专项面上项目,基于计算智能算法的药物靶点预测研究,2017/01-2019/12,20万,在研,项目主持 [2]
国家自然科学基金重点项目,11631014,图理论和算法研究及其在生物信息学中的应用,2017/01-2021/12,230万,在研,项目骨干 [2]
中国矿业大学越崎学者人才引进项目,基于非编码RNA的生物大数据研究及生物信息研究所平台建设,2016/06-2021/05,200万,在研,项目主持 [2]
北京理工大学智能控制与复杂系统国家重点实验室基金,基于问题结构的自学习群智能优化生产调度理论与方法,2015/01-2015/12,3万,结题,项目骨干 [2]
国家自然科学基金青年基金,11301517,多视角识别人类复杂疾病相关microRNA的数学模型与方法研究,2014/01-2016/12,22万,在研,项目主持 [2]
国家自然科学基金专项基金项目数学天元基金,11326042,协同药物研发中的关键数学问题,2013/10-2014/09,20万,已结题,项目骨干 [2]
国家自然科学基金重大研究计划培育项目,91229127,非可控性炎症调控网络体内定量监视预测技术研究,2013/01-2015/12,110万,已结题,项目骨干 [2]
中国科学院国家数学与交叉科学中心数学与生物医学交叉研究部重大专项,重大慢性多发疾病的动态网络系统构建,2012/07-2016/05,参加 [2]
首都安全技术支撑平台(一期),安全生产数据挖掘与模型构建,2012/01-2013/06,结题,项目骨干 [2]
北京市科技计划项目,城市公共设施事故应急的多部门协同决策模型研究,2009/06-2010/12,已结题,项目骨干 [2]
北京市科委课题,首都安全生产风险评估与预测预警技术研究的子课题安全生产数据挖掘与模型构建研究,2009/06-2010/12,已结题,项目骨干 [2]
中科院知识创新工程重要方向项目,生物分子网络中的模型与算法,2008/01-2012/12,已结题,参加 [2]

获奖情况

2018-2019年度中国矿业大学“科研育人”先进个人,2020 [2]
2019年科睿唯安全球高被引科学家,2019 [2]
2017全球排名前十万科学家,2019 [2]
江苏省科学技术奖三等奖《基于大数据处理与挖掘技术的生物信息学研究》,2019 [2]
江苏省教育教学与研究成果奖高校自然科学研究类一等奖《基于复杂网络和机器学习的生物信息学研究》,2018 [2]
第六届淮海科学技术奖—科技英才奖,2018 [2]
2016—2017年度徐州市自然科学优秀学术论文二等奖,2018 [2]
沈阳市自然科学学术成果奖二等奖,2018 [2]
第六届徐州市优秀科技工作者, 2018 [2]
中国矿业大学2018年度高质量通识教育公选课(大数据时代的人工智能算法及其应用), 2018 [2]
江苏省第十四批“六大人才高峰”高层次人才,2017 [2]
第七届图论与组合算法国际研讨会青年论文奖二等奖,2017 [2]
教育部高等学校科学研究优秀成果奖自然科学奖二等奖《复杂生物数据的特征建模及高效学习理论与应用》,2016 [2]
中国矿业大学越崎学者,2016 [2]
Best Paper Award of the 2014 5th International Conference on Game Theory for Networks, 2014. [2]

学术活动

在中科院一区期刊Bioinformatics (影响因子4.531,5篇,4篇第一作者,5篇通讯作者)、PLoS Computational Biology (影响因子4.428,6篇,4篇第一作者,5篇通讯作者)、Nucleic Acids Research (影响因子11.147, 2篇,1篇通讯作者)、Briefings in Bioinformatics (影响因子9.101,7篇,6篇第一作者,7篇通讯作者)等期刊发表SCI论文117篇,其中第一作者54篇, 通讯作者97篇。以一作或通讯发表中科院一区论文19篇,以一作或者通讯发表中科院二区以上论文59篇(中科院分区按照最新基础版)。 发表论文被Nature Reviews Genetics、Nature Chemistry、Nature Reviews Endocrinology、Nature Communications、Genome Biology、Circulation、Gut、Circulation Research、Pharmacology & Therapeutics、Trends in Genetics等期刊SCI引用共计4923次,H-因子为33,15篇论文SCI引用次数超过100,单篇最高SCI引用次数为473,17篇论文入选最新一期ESI高被引论文,2篇论文入选最新一期ESI热点论文,工作引起国内外相关研究人员的广泛兴趣和关注。以第一或通讯作者在Bioinformatics、PLoS Computational Biology和Briefings in Bioinformatics三大数学与计算生物学中科院一区期刊上同时发表论文(从2013年到2020年内在这三大期刊发表论文18篇,14篇第一作者,17篇通讯作者)。 [1-4]
专利:一种药物增效组合预测方法及实验验证. 201110210508.0 闫桂英 张立新 陈兴 任彪 陈明 王令新 刘明熹 正式授权 [1-4]
副主编:Journal of Cellular and Molecular Medicine(SCI, 影响因子4.658,2020-2021) 、Frontiers in Genetics (SCI, 影响因子4.151,2018-2019)、Frontiers in Plant Science (SCI, 影响因子3.678,2018-2019)、BMC Bioinformatics(SCI, 影响因子2.213,2019-2021)、BMC Systems Biology (SCI, 影响因子2.050,2017-2021)、Interdisciplinary Sciences-Computational Life Sciences(SCI, 影响因子0.796,2018-2021) [1-4]
编委:International Journal of Molecular Sciences(影响因子4.183,2019-2021)、International Journal of Biological Sciences(影响因子4.067,2020-2021)、Briefings in Functional Genomics(影响因子3.133,2020-2021)、Scientific Reports (SCI,影响因子4.122,2017-2021)、Current Protein & Peptide Science (SCI, 影响因子2.696,2017-2021)、Current Gene Therapy(影响因子2.218,2020-2021)、Current Proteomics(SCI, 影响因子0.606,2018-2021)、Current Bioinformatics (SCI, 影响因子0.54,2019-2021) [1-4]
首席特约编委: 首席特约编委: Frontiers in Microbiology (SCI, 影响因子4.019, Special issue on Bioinformatics in Microbiota,2017-2019); Current Medicinal Chemistry (SCI, 影响因子3.469, Special issue on Computational Methods for drug discovery,2017-2018); International Journal of Molecular Sciences (SCI, 影响因子3.687, Special issue on Computational Models in Non-Coding RNA and Human Disease,2018-2019); Current Topics in Medicinal Chemistry (SCI, 影响因子3.374, Special issue on Application of Computational Techniques in Pharmacy and Medicine, 2017-2018); Current Protein & Peptide Science (SCI, 影响因子2.696, Special issue on Identifying drug–target interactions based on heterogeneous biological data,2014-2018); BioMed Research International (SCI, 影响因子2.583, Special issue on Current Computational Models for Prediction of the Varied Interactions Related to Non-Coding RNAs, 2016); Protein & Peptide Letters (SCI, 影响因子1.039, Special issue on Current Computational Models for Prediction of the Varied Interactions Related to Protein, 2017-2019). [1-4]
程序委员会成员:The 6th IEEE International Conference on Systems Biology (ISB 2012), The 7th International Conference on Systems Biology (ISB 2013), The 8th International Conference on Systems Biology (ISB 2014), The 4th Translational Bioinformatics Conference (TBC 2014), The 10th International Conference on Systems Biology (ISB 2016), The 13th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA 2017), The 11th International Conference on Computational Systems Biology (ISB 2017), The 14th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA 2018), The 15th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA 2019), 2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2019), The Fourth CCF Bioinformatics Conference (CBC 2019), The 18th Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC 2020), The 16th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA 2020), 2020 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2020) [1-4]
担任中国工业与应用数学学会数学生命科学专业委员会秘书长 [2]
担任中国计算机学会生物信息学专业委员会委员 [2]
担任江苏省生物信息学专业委员会委员 [2]
担任江苏省人工智能学会智能系统与应用专业委员会委员 [2]
担任北京青少年科技俱乐部活动委员会学术指导导师 [2]
担任《2012-2013运筹学学科发展报告》编写组成员 [2]

著作成果

播报
编辑
  1. 1.
    Xing Chen* and Gui-ying Yan*. Novel human lncRNA-disease association inference based on lncRNA expression profiles. Bioinformatics. 2013 29(20): 2617-2624 (SCI, IF: 4.531, cited 260 times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  2. 2.
    Xing Chen*, Chenggang Clarence Yan, Xiaotian Zhang, Xu Zhang, Feng Dai, Jian Yin, Yongdong Zhang. Drug–target interaction prediction: databases, web servers and computational models. Briefings in Bioinformatics. 2016 17(4):696-712 (SCI, IF: 9.101, cited 225 times, ESI highly cited paper) [2] [4]
  3. 3.
    Xing Chen, Biao Ren, Ming Chen, Quanxin Wang, lixin Zhang*, Guiying Yan*. NLLSS: Predicting Synergistic Drug Combinations based on semi-supervised learning. PLoS Computational Biology. 2016 12(7): e1004975 (SCI, IF: 4.428, cited 121 times, ESI highly cited paper) [2] [4]
  4. 4.
    Xing Chen*, Chenggang Clarence Yan, Xu Zhang, Zhu-Hong You*. Long non-coding RNAs and complex diseases: from experimental results to computational models. Briefings in Bioinformatics. 2017 18(4):558-576 (SCI, IF: 9.101, cited 257 times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  5. 5.
    Zhuhong You, Zhi-An Huang, Ze-Xuan Zhu*, Gui-Ying Yan, Zheng-Wei Li, Zhenkun Wen, Xing Chen*. PBMDA: A novel and effective path-based computational model for miRNA-disease association prediction. PLoS Computational Biology. 2017 13(3): e1005455 (SCI, IF: 4.428, cited 180 times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  6. 6.
    Xing Chen*, Yu-An Huang, Zhu-Hong You*, Gui-Ying Yan, Xue-Song Wang*. A Novel Approach based on KATZ measure to Predict Associations of Human Microbiota with Non-Infectious Diseases. Bioinformatics. 2017 33(5):733-739 (SCI, IF: 4.531, cited 87 times, ESI highly cited paper) [2] [4]
  7. 7.
    Xing Chen*, Li Huang. LRSSLMDA: Laplacian Regularized Sparse Subspace Learning for MiRNA-Disease Association prediction. PLoS Computational Biology. 2017 13(12): e1005912 (SCI, IF: 4.428,cited 130 times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  8. 8.
    Xing Chen*, Lei Wang, Jia Qu, Na-Na Guan, Jian-Qiang Li. Predicting miRNA-disease association based on inductive matrix completion. Bioinformatics. 2018 34(24): 4256-4265 (SCI, IF: 4.531, cited 128 times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  9. 9.
    Xing Chen*, Di Xie, Lei Wang, Qi Zhao*, Zhu-Hong You, Hong-Sheng Liu. BNPMDA: Bipartite Network Projection for MiRNA-Disease Association prediction. Bioinformatics. 2018 34(18): 3178-3186 (SCI, IF: 4.531, cited 124 times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  10. 10.
    Xing Chen*, Jun Yin, Jia Qu, Li Huang. MDHGI: Matrix Decomposition and Heterogeneous Graph Inference for miRNA-disease association prediction. PLoS Computational Biology. 2018 14(8): e1006418 (SCI, IF: 4.428, cited107times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  11. 11.
    Xing Chen*, Li Huang, Di Xie, Qi Zhao. EGBMMDA: Extreme Gradient Boosting Machine for MiRNA-Disease Association prediction. Cell Death & Disease. 2018 9: 3 (SCI, IF: 5.959, cited 96 times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  12. 12.
    Hui Liu, Huaizhi Wang, Zhen Wei, Songyao Zhang, Gang Hua, Shao-Wu Zhang, Lin Zhang, Shou-Jiang Gao, Jia Meng*, Xing Chen*, Yufei Huang*. MeT-DB V2.0: elucidating context-specific functions of N-methyl-adenosine methyltranscriptome. Nucleic Acids Research. 2018 46(Database issue): D281-D287 (SCI, IF: 11.147, cited 27 times) [2] [4]
  13. 13.
    Xing Chen*, Di Xie, Qi Zhao, Zhu-Hong You. MicroRNAs and complex diseases: from experimental results to computational models. Briefings in Bioinformatics. 2019 20(2):515-539 (SCI, IF: 9.101, cited 151 times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  14. 14.
    Xing Chen*, Ya-Zhou Sun, Hui Liu, Lin Zhang*, Jian-Qiang Li*, Jia Meng. RNA methylation and diseases: experimental results, databases, web servers and computational models. Briefings in Bioinformatics. 2019 20(3):896-917 (SCI, IF: 9.101, cited 17 times). [2] [4]
  15. 15.
    Xing Chen*, Chi-Chi Zhu, Jun Yin. Ensemble of decision tree reveals potential miRNA-disease associations. PLoS Computational Biology. 2019 15(7): e1007209 (SCI, IF: 4.428, cited 18 times). [2] [4]
  16. 16.
    Yan Zhao, Xing Chen*, Jun Yin. Adaptive boosting-based computational model for predicting potential miRNA-disease associations. Bioinformatics. 2019 35(22): 4730-4738 (SCI, IF: 4.531, cited 16 times). [2] [4]
  17. 17.
    Lei Wang, Zhuhong You*, Xing Chen*, Yang-Ming Li, Ya-Nan Dong, Li-Ping Li, Kai Zheng. LMTRDA: Using logistic model tree to predict MiRNA-disease associations by fusing multi-source information of sequences and similarities. PLoS Computational Biology. 2019 15(3):e1006865 (SCI, IF: 4.428, cited 30 times). [2] [4]
  18. 18.
    Xing Chen*, Lian-Gang Sun, Yan Zhao. NCMCMDA: miRNA–disease association prediction through neighborhood constraint matrix completion. Briefings in Bioinformatics. 2020 Advance Access (SCI, IF: 9.101). [2] [4]
  19. 19.
    Xing Chen*, Na-Na Guan, Ya-Zhou Sun, Jian-Qiang Li, Jia Qu. MicroRNA-small molecule association identification: from experimental results to computational models. Briefings in Bioinformatics. 2020 21(1): 47-61 (SCI, IF: 9.101, cited 32 times, ESI highly cited paper). [2] [4]
  20. 20.
    Chun-Chun Wang, Yan Zhao, Xing Chen*. Drug-pathway association prediction: from experimental results to computational models. Briefings in Bioinformatics. 2020 Advance Access (SCI, IF: 9.101). [2] [4]